Sprężarki wodorowe są dostępne w różnych typach, w tym membranowych, tłokowych, rotacyjnych, śrubowych i turbinowych. Odpowiedni typ wybiera się na podstawie natężenia przepływu, ciśnienia wlotowego i ciśnienia wylotowego. Sprężarki tłokowe charakteryzują się dużym natężeniem przepływu, a jednostopniowy-współczynnik sprężania wynosi zazwyczaj od 3:1 do 4:1. Sprężarki membranowe szybko odprowadzają ciepło, a proces sprężania jest zbliżony do izotermicznego, co pozwala na uzyskanie wyższych współczynników sprężania, aż do 20:1. Jednak ze względu na mniejsze natężenie przepływu stosuje się je głównie w zastosowaniach wymagających wyższego ciśnienia wodoru, ale niższych natężeń przepływu.
Ogólnie rzecz biorąc, sprężarki o ciśnieniach poniżej 30 MPa to zazwyczaj sprężarki tłokowe, ponieważ doświadczenie wykazało ich wysoką niezawodność i można je stosować niezależnie w sprężarkach wielostopniowych-. Dla ciśnień powyżej 30 MPa i mniejszych strumieni objętości powietrza można zastosować sprężarki membranowe. Zaletą sprężarek membranowych jest ich niezawodne uszczelnienie pod wysokim ciśnieniem: ponieważ konstrukcją uszczelniającą ich komorę gazową jest membrana umieszczona pomiędzy głowicą cylindrów a blokiem cylindrów, zabezpieczona głównymi śrubami w celu utworzenia uszczelnienia statycznego, zapewniającego brak wycieków gazu. Ponadto komora membrany jest zamknięta, co zapobiega kontaktowi z kroplami oleju, mgłą olejową lub innymi zanieczyszczeniami, zapewniając, że dopływający gaz nie zostanie zanieczyszczony czynnikami zewnętrznymi podczas sprężania. Jest to szczególnie korzystne w zastosowaniach wymagających mediów o wysokiej czystości. Konstrukcja sprężarki wodoru obejmuje podstawowe elementy (takie jak skrzynia korbowa, wał korbowy, korbowody itp.), elementy bloku cylindrów, elementy tłoków, elementy chłodnicy, systemy zabezpieczeń i sterowania oraz inne elementy pomocnicze.